Войти
Образовательный портал. Образование
  • Лунин, михаил сергеевич Лунин Николай Иванович: витамины
  • Скончался академик борис сергеевич соколов Соколов, Борис Сергеевич Информацию О
  • Рецепты варенья из кабачков с лимоном, с курагой и в ананасовом соке
  • Как приготовить вкусные куриные сердечки с картофелем в мультиварке Куриные сердечки рецепт в мультиварке с картофелем
  • Сырный суп с курицей и грибами Куриный суп с сыром и грибами
  • Четверка монет таро значение
  • Какая химическая связь у воды. Связь молекул воды между собой

    Какая химическая связь у воды. Связь молекул воды между собой

    Молекулы воды связаны между собой посредством водородных связей, расстояние между атомами кислорода и водорода равно 96 пм, а между двумя водородами - 150 пм. В твёрдом состоянии атом кислорода участвует в образовании двух водородных связей с соседними молекулами воды. При этом отдельные молекулы H 2 O соприкасаются друг с другом разноимёнными полюсами. Таким образом, образуются слои, в которых каждая молекула связана с тремя молекулами своего слоя и одной из соседнего. В результате, кристаллическая структура льда состоит из шестигранных "трубок" соединенных между собой, как пчелиные соты.

    Наиболее важными методами получения информации о структуре биомолекул являются нейтронная и рентгеновская дифракция. В первом случае пучок нейтронов направлен на небольшой образец и регистрирует, как частицы рассеиваются. Каждое свободное пространство между молекулами действует как крошечный зазор, что вызывает характерную картину дифракции. Из анализа этих закономерностей можно определить расстояния между молекулами. Если сравнивать эти значения с результатами компьютерного моделирования, то в среднем получается хорошее совпадение.

    Согласно данным компьютерного моделирования, при диаметре трубки в 1,35 нм и давлении в 40000 атмосфер водородные связи искривились, приведя к образованию спирали с двойной стенкой. Внутренняя стенка этой структуры является скрученной в четверо спиралью, а внешняя состоит из четырёх двойных спиралей, похожих на структуру молекулы ДНК.

    Чтобы экспериментально проверить вычисленную молекулярную динамику, можно сравнить предсказанное поведение биомолекулы в воде со свойствами, наблюдаемыми в лаборатории. Например, большинство белков содержат по меньшей мере одну альфа-спираль, в которой аминокислотная цепь спирали. Эксперименты показали, что эта спиральная структура растворяется при нагревании; однако в ранних симуляциях простой альфа-спирали в вакууме она сохранялась даже при повышенной температуре. Только Левитт и Валери Даггетт из Вашингтонского университета в Сиэтле смогли воспроизвести «обмотку» винтовой лестницы под воздействием тепла, включив молекулы воды в симуляцию.

    Последний факт накладывает отпечаток не только на эволюцию наших представлений о воде, но и эволюцию ранней жизни и самой молекулы ДНК. Если предположить, что в эпоху зарождения жизни криолитные глинистые породы имели форму нанотрубок, возникает вопрос - не могла ли вода, сорбированная в них служить структурной основой – матрицей для синтеза ДНК и считывания информации? Возможно, поэтому спиральная структура ДНК повторяет спиральную структуру воды в нанотрубках. Как сообщает журнал New Scientist, теперь нашим зарубежным коллегам предстоит подтвердить существование таких макромолекул воды в реальных экспериментальных условиях с использованием инфракрасной спектроскопии и спектроскопии нейтронного рассеяния.

    Численные модели становятся все более мощным инструментом для более глубокого понимания формы биомолекул и их функций в организме. Однако компьютерные технологии и стоимость вычислительного времени на суперкомпьютерах продолжают ограничивать усилия по моделированию все более сложных биомолекул в водной среде. Тем не менее структурные модели белков в научных журналах обычно изображены на черном фоне; однако этот фон, в котором существуют молекулы, а именно вода, в конечном счете столь же важен, как и сам.

    Первичные и вторичные химические связи

    Химическая химия Химические молекулы и облигации Все элементы могут образовывать связи, за исключением благородных газов, имеющих полный внешний уровень. Благородные газы могут связываться с фтором, потому что он является самым электроотрицательным атомом, и поэтому они не являются полностью инертными. Другие элементы для связывания должны покупать электроны или давать, зависит от того, сколько у них между атомами являются сильными связями, между слабыми молекулами связей Между неметаллами = молекулы, образующие ковалентную связь Между металлами - металлическая связь - образующиеся сплавы Между металлами и неметаллами = ионная связь соединяются положительными ионами и отрицательными ионами. Умирающее звено = только один элемент делает электроны доступными. единственный, чтобы образовать молекулы. Она образуется между неметаллами, которые имеют равную или аналогичную электроотрицательность и которые имеют пару электронов. Ионная связь. Она образуется между металлом, а не металлом. неметалл, который приобретает те, которые ему необходимы для завершения внешнего слоя. Свойства ионных соединений. Все они твердые, потому что это очень прочная связь. Они представляют собой кристаллические соединения, то есть они имеют четкую форму и линию разрушения. Металлическая связь. Она образуется между металлическими атомами, образуются сплавы. Это набор положительных ионов, потому что они дают электроны. Вокруг него есть облако делокализованных электронов. Он ведет ток, потому что входящие электроны толкают то, что делокализуют, и они выходят. Они проводят тепло, потому что связь между молекулами. Водородная связь. Это связь между молекулами, которые содержат водород, связанный с очень электроотрицательным элементом. Так что это очень сильная связь. Дипольный диполь Постоянные полярные молекулы всегда будут полярными. Индуцированные = аполярные молекулы, которые расплавляются в воде, потому что полярные молекулы воды делают молекулы этих веществ полярными. Временно индуцируется = охлаждение и сжатие газа, его молекулы замедляются и они приближаются, а его молекулы от аполярны становятся полярными, а газ становится жидким, но должен оставаться в этих условиях. Полярные вещества растворяют соединения, то аналогичные расплавы аналогичны. Точка кипения зависит от трех факторов: давления, гравитационного притяжения, связи между молекулами. Связь между молекулами: водородная связь, дипольная дипольная ковалентная связь. . Химия - простая и точная классификация первичных химических связей и вторичных химических связей.

    Такие исследования нанокристаллов льда были проведены в 2007 году Микаелидес из Центра нанотехнологий в Лондоне и Моргенштерн из университета им. Лейбница в Ганновере (рис. 36). Они охлаждали водяной пар над поверхностью металлической пластины, находящейся при температуре 5 градусов Кельвина. Вскоре с помощью сканирующего туннельного микроскопа на пластине удалось наблюдать гексамер (шесть соединенных между собой молекул воды) - мельчайшую снежинку. Это самый маленький из возможных кластеров льда. Ученые наблюдали также кластеры, содержащие семь, восемь и девять молекул.

    Рис . 36. Изображение гексамера воды, полученное с помощью сканирующего туннельного микроскопа Размер гексамера в поперечнике - около 1 нм. Фото London Centre for Nanotechnology

    Разработка технологии, позволившей получить изображение гексамера воды - само по себе важное научное достижение. Для наблюдения пришлось сократить зондирующий ток до минимума, что и позволило предохранить слабые связи между отдельными молекулами воды от разрушения вследствие процесса наблюдения. Помимо этого, в работе были использованы теоретические подходы квантовой механики. Комплексный подход дал впечатляющие результаты.

    В отличие от кристаллического льда, где между всеми молекулами воды энергия связи одинакова, в нанокластерах есть чередование сильных и слабых связей (и соответствующих расстояний) между отдельными молекулами. Получены также важные результаты о способности молекул воды к распределению водородных связей и к их связи с поверхностью металла.

    Теоретические анализы Опарина, эксперименты Миллера, Фокса и др. бесспорно доказывают, что в природе могут структурироваться органические молекулы из неорганических. Главным источником энергии в их экспериментах является тепло. В природе это солнечная радиация и энергия магмы. Другой очень существенный вывод – это, что зарождение жизни может произойти в щелочной среде. Во всех случаях наблюдается самоорганизация живого.

    В XIX в. Пастьор обратил внимание, что в неживой природе молекулы являются симметричными. А в живой природе наблюдается зеркальная ассиметрия молекул. Белки состоят из левовращающих аминокислот. Данное свойство определяется вращением молекулой плоскости поляризации света. Как объяснить феномен?

    Возможно, наличие ассиметрии в органических молекулах проявилось, когда открытая система, предшествувающая биосфере, находилась в крайне неравновесном критическом состоянии.

    Произошел скачкообразный эволюционный переход, что является характерной особенностью самоорганизации. Примером такого состояния являются эксперименты, где водные молекулы напоминают ДНК в нанотрубах. Переход из симметричных молекул неживой природы к ассиметричным биомолекулам живой мог произойти на начальном этапе химической эволюции, как самоорганизация материи. Проф. Антонов доказал, что вода тоже является открытой системой и обменивается энергией и веществом с окружающей средой (проф. Антонов, 1992).

    Такие экстремальные условия наблюдаются при вулканической деятельности, разрядах в атмосфере молодой Земли. Минеральная вода, взаимодействуюшая с карбонатом кальция, а также морская вода, являются благоприятным спектром для сохранения самоорганизующихся структур. Эффект Кирлиана в лабораторных условиях создает селективный разряд, позволяющий наблюдать излучение света атомами или молекулами. При экспериментах Миллера также создаются неравновесные экстремальные условия с газовым разрядом.

    Кирлиановая аура - плазменное свечение электрического разряда наблюдается на поверхности предметов, находящихся в переменном электрическом поле высокой частоты 10-100 кГц, при котором возникает поверхностное натяжение между электродом и исследуемым объектом от 5 до 30 кВ. Эффект Кирлиана наблюдается подобно молниям или статическому разряду на любых биологических, органических объектах, а также на неорганических образцах различного характера.

    Для визуализации Кирлиановой ауры на электрод подаётся высокое переменное напряжение с высокой частотой - от 1 до 40 киловольт при 200-15000 Герц. Другим электродом служит сам объект. Оба электрода разделены изолятором и тонким слоем воздуха, молекулы которого подвергаются диссоциации под действием сильного магнитного поля, возникающего между электродом и объектом. В этом слое воздуха, находящемся между объектом и электродом, происходит три процесса.

    Первый процесс заключается в ионизации и образовании атомарного азота.

    Второй процесс – ионизация молекул воздуха и образования ионного тока – коронного разряда между объектом и электродом. Форма короны свечения, её плотность и т.п. определяются собственным электромагнитным излучением объекта.

    Третий процесс - переход электронов с низших на высшие энергетические уровни и обратно. При этом переходе электронов происходит излучение кванта света. Величина перехода электрона зависит от собственного электромагнитного поля исследуемого объекта. Поэтому в различных точках поля, окружающего объект, электроны получают разные импульсы, т.е. перескакивают на разные энергетические уровни, что приводит к испусканию квантов света разной длины и энергии. Последние регистрируются человеческим глазом или цветной фотобумагой в качестве различных цветов, которые в зависимости от объекта могут окрашивать корону свечения в различные цвета. Эти три процесса в своей совокупности дают общую картину кирлиан-эффекта, который позволяет изучать электромагнитное поле объекта. Эффект Кирлиана, таким образом, связан с биоэлектрической аурой живого объекта.

    Структуру водородной связи мы с вами разберём на примере взаимодействия молекул воды между собой.

    Молекула воды является диполем . Это объясняется тем, что атом водорода , связанный с более электроотрицательным элементом кислородом , имеющим , испытывает недостаток электронов и поэтому способен взаимодействовать с атомом кислорода другой молекулы воды.

    В результате этого взаимодействия возникает водородная связь (Рис. 2.1 ):

    2.1. Механизм образования водородной связи между молекулами воды

    Это объясняется тем, что атом водорода , связанный с более электроотрицательным элементом, имеющим неподелённую электронную пару (азотом, кислородом, фтором и др.), испытывает недостаток электронов и поэтому способен взаимодействовать с неподелённой парой электронов другого электроотрицательного атома этой же или другой молекулы.

    В результате также возникает водородная связь , которая графически обозначается тремя точками (Рис.):

    Рис. 2.2. Механизм образования водородной связи между протоном (Н . δ + ) и более электроотрицательными атомами серы(: S δ - ), кислорода (: O δ - ) и азота (: N δ - )

    Эта связь значительно слабее других химических связей (энергия ее образования 10-40 кДж/моль ), и, в основном, определяется электростатическим и донорно-акцепторным взаимодействиями.

    Водородная связь может быть как внутримолекулярной , так и межмолекулярной .

    2.1.4. Гидрофобные взаимодействия

    Прежде, чем рассматривать природу гидрофобного взаимодействия , необходимо ввести понятие «гидрофильных» и «гидрофобных» функциональных групп .

    Группы, которые могут образовывать водородные связи с молекулами воды, называются гидрофильными .

    К этим группам относятся полярные группы: аминогруппа (- NH 2 ) , карбоксильная (- COOH ), карбонильная группы (- CHO ) и сульфгидрильная группа (- SH ).

    Как правило, гидрофильные соединения хорошо растворимы в воде. !!! Это обусловлено тем, что полярные группы способны образовывать водородные связи с молекулами воды .

    Появление таких связей сопровождается выделением энергии , поэтому и возникает тенденция к максимальному увеличению поверхности контакта заряженных групп и воды (Рис. 2.3 ):

    Рис. 2.3. Механизм образования гидрофобных и гидрофильных взаимодействий

    Молекулы или части молекул, неспособные образовывать водородные связи с водой называются гидрофобными группами .

    К этим группам относятся алкильные и ароматические радикалы, которые неполярны и не несут электрического заряда.

    Гидрофобные группы плохо или вовсе не растворимы в воде.

    Это объясняется тем, что атомы и группы атомов , входящие в состав гидрофобных групп, являются электронейтральными и (поэтому) не могут образовывать водородных связей с водой.

    !!! Гидрофобные взаимодействия возникают в результате контакта между неполярными радикалами, неспособными разорвать водородные связи между молекулами воды.

    В результате этого молекулы воды вытесняются на поверхность гидрофильных молекул (Рис. 2.3 ).

    2.1.5. Ван-дер-ваальсовы взаимодействия.

    В молекулах существуют также весьма слабые и короткодействующие силы притяжения между электрически нейтральными атомами и функциональными группами.

    Это так называемые ван-дер-ваальсовые взаимодействия .

    Они обусловлены электростатическим взаимодействием между отрицательно заряженными электронами одного атома и положительно заряженным ядром другого атома.

    Так как ядра атомов экранированы окружающими их собственными электронами от ядер соседних атомов, то возникающие между различными атомами ван-дер-ваальсовы взаимодействия весьма невелики .

    Все эти типы взаимодействий принимают участие в формировании , поддержании и стабилизации пространственной структуры (конформации ) белковых молекул (Рис. 2.4 ):


    Рис. 2.4. Механизм образования ковалентных связей и слабых нековалентных взаимодействий: 1 - электро-статические взаимодействия; 2 – водородные связи; 3 – гидрофобные взаимодействия, 4 – дисульфидные связи

    Силы, которые способствуют формированию пространственной структуры белков и удерживающие её в стабильном состоянии , являются очень слабыми силами . Энергия этих сил на 2-3 порядка меньше энергии ковалентных связей. Они действуют между отдельными атомами и группами атомов.

    Однако, огромное число атомов в молекулах биополимеров (белков), приводит к тому, что суммарная энергия этих слабых взаимодействий становится сравнима с энергией ковалентных связей.